Μέσα από το Tiny Giants 3D ένας σκίουρος σε ένα άγριο δάσος και ένα εντομοφάγο ποντίκι σε μια έρημο της Αριζόνας αναγκάζονται και οι δύο να μεγαλώσουν γρήγορα, όταν βρίσκονται για πρώτη φορά μόνα τους στην άγρια φύση. Πρέπει να χρησιμοποιήσουν τις υπερδυνάμεις τους ώστε να μείνουν όχι μόνο ζωντανοί, αλλά και να γίνουν κυρίαρχοι του σύμπαντός τους.