H Aeon Flux (Charlize Theron) είναι μια ατρόμητη αγωνίστρια σε μια πόλη του μέλλοντος την Bregna την μοναδική που έχει απομείνει μετά από ολοκληρωτική οικολογική καταστροφή. Όταν η αδερφή της Una σκοτώνεται από ανθρώπους του καθεστώτος η Aeon γίνεται ακόμα πιο αποφασισμένη να ανατρέψει τον αρχηγό του Trevor Goodchild (Marton Csokas) που κυβερνά για 400 χρόνια ήδη. Δέχεται λοιπόν με ευχαρίστηση την αποστολή που της δίνεται να σκοτώσει τον Trevor αλλά την κρίσιμη στιγμή που τον συναντά δεν μπορεί να το κάνει μιας και ο Trevor της φαίνεται περίεργα οικείος. Πολύ γρήγορα τα πράγματα όμως γίνονται πολύ άσχημα και για τους δύο καθώς ο νεότερος αδερφός του Oren αναλαμβάνει την εξουσία και το ζευγάρι πρέπει να ματαιώσει πάση θυσία τα σατανικά σχέδια του νέου κυβερνήτη.