Βρισκόμαστε στο έτος 2306. Δώδεκα χρόνια πέρασαν από τότε που ο κυβερνήτης Τζέημς Κερκ χάθηκε μέσα στο Νέξους, σώζοντας το πλήρωμα του Εντερπράιζ-Β. Δυστυχώς, μετά από ένα χρόνο, ο αντιπλοίαρχος Μοντγκόμερι Σκοτ χάθηκε μαζί με το πλήρωμα και τους επιβάτες του σκάφους USS Τζενόλεν, χωρίς να έχουν βρεθεί έως σήμερα. Οι υπόλοιποι από το πλήρωμα του USS Εντερπράιζ έχουν διαλέξει διαφορετικούς δρόμους στην καριέρα τους.