Βρισκόμαστε στον 30ο αιώνα όπου μια εξαθλιωμένη Γη έχει υποδουλωθεί από μια εξωγήινη φυλή, τους Illumidus.Ένας κυβερνήτης ενός προσφυγικού σκάφους, ο Harlock, χάνει το πλοίο του από τις αρχές των εξωγήινων.Η γνωριμία με τον Tochiro έναν επίσης άνεργο πιλότο, η επαφή με τον Zoll ενός αξιωματούχου του στρατού των Illumidus αλλά και η συνάντηση με τη Maya, του έρωτα του Harlock, πρόκειται να στοιχίσουν πολλά στον ίδιο αλλά και να αλλάξουν την μοίρα του.Δράμα, ρομαντισμός, sci-fi και μια αποστροφή στο παράλογο του πολέμου είναι οι λέξεις κλειδιά γι αυτό το αριστουργηματικό έπος.