Σαν να μην έφτανε ο ένας Τζόουνς για να αναστατώσει τον κόσμο, τώρα εμφανίζεται και δεύτερος Τζόουνς. Είναι ο Δρ. Τζόουνς, σοβαρός επιστήμονας, πατέρας του Ιντιάνα, που μαζί με τον γιο του έχουν βαλθεί να ανακαλύψουν το χαμένο Ιερό Δισκοπότηρο, που είχε χαθεί απ΄την εποχή της τελευταίας σταυροφορίας. Περιττό να πούμε, βέβαια, ότι υπάρχουν και οι κακοί Γερμανοί που ενδιαφέρονται για το ίδιο αντικείμενο. Κι έτσι οι δύο Τζόουνς θα μπλέξουν σε μια σειρά από απίθανες περιπέτειες ώσπου να μπορέσουν να φτάσουν στο μέρος όπου είναι κρυμμένο το Αγιο Δισκοπότηρο.